Le milieu lacustre
Lac du Bourget
La plupart des lacs datent de la fin des glaciations ; ils occupent des cuvettes souvent profondes (145 m au Bourget, 71 m à Aiguebelette). En fonction de la topographie et des apports d'alluvions, une ceinture de végétation plus ou moins développée s'implante. L'étang (Crosagny, Aigrettes) est une eau plus petite et close, souvent d'origine anthropique : pisciculture ou alimentation d’un moulin, par exemple. La végétation y est beaucoup plus développée. Les lacs présentent trois "ceintures "de végétation depuis le large vers les berges : les herbiers immergés jusqu'à 8 m de profondeur (plus de 300 ha et 20 espèces au Bourget), la végétation flottante (nénuphars blanc et jaune, potamot noueux), et les "roselières" (roseau, scirpe lacustre, massette). Les herbiers immergés sont dominés par les characées, dont les matelas denses et rêches indiquent une eau de bonne qualité. Les secteurs abrités hébergent souvent une forte diversité floristique (potamot, élodée, myriophylle …).
Dans les étangs, on retrouvera des herbiers immergés souvent luxuriants et "nitrophiles" (qui se développent en milieu azoté) : myriophylle, potamot, ainsi que les roselières. Les berges de rocher, gravier ou sable sont d'une grande richesse bien que d’apparence nue. Les poissons dépendent pour leur frai soit des affluents et berges graveleuses (lavaret, goujon, truite …), soit de la végétation (carpe, brochet …). Celle-ci détermine également la richesse des chaînes alimentaires. Quant aux oiseaux, si l'eau libre peut suffire à leur alimentation (surtout chez les hivernants), la végétation des berges est vitale pour leur nid et une partie de l'élevage des jeunes (canard, grèbe, foulque). Les roselières sont l'habitat de plusieurs oiseaux rares : blongios, busard des roseaux, héron pourpré, râle d'eau … Une première menace pour les plans d'eau est l'artificialisation des berges et la pression des loisirs nautiques. Le Conservatoire peut agir par la maîtrise foncière et par incitation à un zonage respectant les enjeux biologiques. Pour enrayer le déclin des roselières (plus de 60 % en 50 ans au Bourget), le Conservatoire a initié à la fois un programme de restauration (apport de matériaux sur les berges érodées, ouvrages de protection anti-houle et plantation de roseaux) et une renégociation des niveaux du lac avec notamment le rétablissement des étiages de fin d'été, permettant le renouvellement des roselières. Roselière, sud du lac du Bourget Blongios nain
